圓筒式分子蒸餾器
材料以真空狀態放入缸內，用加熱器加熱，凝結成冷凝器。該裝置構造簡潔，操作便捷，但蒸發面不移動，液層無法更新，蒸餾持續加熱，熱分解容易，效率低，不適合熱不穩定物料蒸餾。
降膜式分子蒸餾器
該裝置的冷凝表層和蒸發表層為兩個同心圓柱，材料在重力作用下沿蒸發表層流動，形成連續更新的液膜。但是，液膜受流量和粘度的影響，厚度不均勻，無法完全復蓋蒸發面，影響了有效面積的蒸發率:同時加熱時間長，塔頂至塔底的壓力損失大，蒸餾溫度升高，熱不穩定的物質適用范圍有限。
刮膜式分子蒸餾器
該裝置改善了薄膜還原分子蒸餾器的缺點,在蒸餾器中設置了旋轉刮刀,將材料迅速、均勻、連續地剝離成液膜。進入到蒸發器底部，不揮發組件從出口流出的殘渣；不凝氣體從真空流出。該裝置能有效地控制薄膜厚度和均勻性，通過刮刀的轉速也能控制材料的停留時間，提高蒸發效率，降低熱分解，可用于蒸發介質熱敏性物質。其構造簡潔，易于制造，操作參數比較容易控制，維修便捷，是目前適用范圍最廣、特性比較完整的一種分子蒸餾器。
離心式分子蒸餾器
該裝置的蒸發器是一個高速旋轉錐形容器，材料從底部進入，通過旋轉表層的離心力覆蓋整個蒸發表層，形成一個連續更新的均勻厚度液膜。蒸發器在蒸發表層停留時間短（0.05～1.5s），凝結在相反的冷凝表層，出水從錐形冷凝器底部抽取，殘渣從蒸發表層外緣通道數據采集，蒸發表層與冷凝表層之間的距離可調，形成的液膜非常薄（一般為0.01～0.1mm），蒸餾效率高，分離效果好。是現代最有效的分子蒸餾裝置，適用于各種原料的蒸餾。但其結構復雜，維修困難，成本很高。
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